Auto-FOX Documentation

• Radial & Angular Distribution Function
  • API
• Root Mean Squared Displacement & Fluctuation
  • Root Mean Squared Displacement
  • Root Mean Squared Fluctuation
  • The atom_subset argument
  • API
• The MultiMolecule Class
  • API FOX.MultiMolecule
• Addaptive Rate Monte Carlo
  • The algorithm
  • Parameters
  • The pes block
  • The param block
  • Parameter Guessing
  • State-averaged ARMC
• Monte Carlo Parameters
  • Index
  • param
  • psf
  • pes
  • pes_validation
  • job
  • monte_carlo
  • phi
• Multi-XYZ reader
  • API
• FOX.ff.lj_param
  • Index
  • API
• PSFContainer
  • Index
  • API
• PRMContainer
  • Index
  • API
• Properties
• Recipes
  • FOX.recipes.param
    • Index
    • API
  • FOX.recipes.psf
    • Index
    • API
  • FOX.recipes.ligands
    • Index
    • API
  • FOX.recipes.time_resolution
    • Index
    • API
  • FOX.recipes.similarity
    • Index
    • API